Según la auditoría forense hecha por una instancia particular, en abril de 2015, a solicitud del médico pediatra del Hospital del Niño, José Luis Delgadillo, coacusado en el caso Alexander, el infante no sufrió violación que derivó en su muerte, sino una bronco aspiración con posterior falla orgánica múltiple que le costó la vida.
La auditoría desarrollada por la especialista Heidy Arteaga Landa del Estudio de Medicina Legal, Ciencias Forenses y Auditoría Médica Arteaga Landa & Asociados, descarta abuso sexual y pone en evidencia la inexperiencia de los peritos del Instituto de Investigaciones Forenses (IDIF), dependiente del Ministerio Público, Ángela Mora y Christian Vargas, y revela indicios de contaminación de las pruebas, conclusiones que no habrían sido tomadas en cuenta por el Tribunal Décimo de Sentencia de La Paz a cargo del juicio por este caso.
El estudio hace un análisis de los exámenes de laboratorio y estudios realizados al bebé Alexander en el Hospital del Niño, Hospital Juan XXII y el IDIF y concluye que "la principal complicación que presentó el paciente Alexander fue coagulopatía de consumo, acompañada de falla orgánica múltiple, secundaria a la insuficiencia respiratoria aguda provocada por la broncoaspiración".
La auditoría dice que "la sangre emanada por región anal del bebé "no provenía de ninguna lesión en anorectal" sino del intestino delgado "en respuesta a un daño del tejido en los órganos que sufren en un evento que genera falta de oxígeno (broncoaspiración por mala ingesta de leche)".
En el documento se lee: "el médico especialista del Hospital Juan XXIII Roberto Gumiel y la médica residente Sandra Madeny describen la sangre emanada por la región anal del bebé como oscura, porracea y fétida mezclada con heces, y estas características son propias de sangrado causado por la falta de oxígeno, mientras que de tratarse de una violación el sangrado que se origina en lesión anorectal es de color brillante, carece de olor fétido, es de consistencia líquida y no se mezcla con las heces".
Otra conclusión que se lee en la auditoría dice: "se demuestra la inadecuada valoración de los médicos forenses, al confundir signos de coagulopatía de consumo y falla orgánica simple con acceso carnal por la región anal... Porque lo registrado por la médica forense Angela Mora en el certificado con código CEN014526/2014, no describe signos de abuso o acceso carnal ni reciente no antiguo".
En el documento se agrega que la forense Mora "utiliza un término genérico al indicar lesión sin especificar qué tipo de lesión (sinónimo) encontró, ¿Era un eritema? ¿Un edema? o ¿Una equimosis?".
